Считается, что караимов пригласил великий князь Витаутас (Витовт) после похода в Крым. Караимы переселились в Тракай с семьями, а место для жилья им было предоставлено в северной части города, между двумя замками великого князя, на нынешней улице Караимов. Община караимов внесла большой вклад в развитие города. Часть города, где жили караимы, раньше называлась «Малым городом».

По рассказам местных караимов, именно их предки охраняли мосты и Островной замок, а также служили личной охраной князя и, будучи хорошими огородниками, прославились особыми сортами огурцов.

В Литве есть действующие кенасы —  в г. Вильнюсе и в Тракае. Там проводятся занятия по изучению караимского языка, на которые приглашаются и крымские караимы из Украины, России и Польши. Имеются государственный этнографический музей, в котором проводятся выставки, посвященные крымским караимам.

Самое известное караимское блюдо — кибины, кыбыны, кибинай (на караимском языке «кыбын», множественное число «кыбынлар»; лит. kibinai). Это очень вкусные пирожки с разными начинками. Классический кибинай делается с бараниной.